Das Hauptziel beim Biofeedback ist die Entwicklung von Selbstkontrolle über körperliche Vorgänge. Die körperlichen Funktionen werden der Person kontinuierlich zurückgemeldet (z.B. optisch oder akustisch) und positive bzw. konstruktive Änderungen dieser Körperfunktion werden verstärkt. Biofeedback wirkt dabei spezifisch auf die ausgewählte Körperfunktion, wodurch negative Nebenwirkungen in der Regel ausbleiben.

Anhand des Zieles "Entspannung" soll hier nun die Vorgangsweise erläutert werden:

1. Auswahl des Biosignales: Zunächst muss das Biosignal ausgewählt werden, das rückgemeldet wird. Diese Auswahl kann auf unterschiedliche Weise erfolgen. Oftmals werden genau jene Körperreaktionen ausgewählt, deren Aktivität mit den Beschwerden des Patienten in Zusammenhang stehen (z.B. können anhaltende Verspannungen der Schulter- und Nackenmuskulatur zu Spannungskopfschmerzen führen).
2. Lernphase: Im nächsten Schritt soll die systematische und entspannungsfördernde Beeinflussung des rückgemeldeten Biosignales erlernt werden. Hierbei kann jede Person, unterstützt durch ihren Biofeedback-Trainer, experimentieren, auf welche Weise sie das rückgemeldete Biosignal am besten beeinflussen kann. Ziel ist es, eine Strategie zu entwickeln, mit deren Hilfe es dem Patienten gelingt, sich zu entspannen. Diese Strategie kann höchst unterschiedlich ausfallen.
3. Trainings- und Anwendungsphase: Gelingt es der Person dann relativ zuverlässig, sich zu entspannen, wird mit ihr daran gearbeitet, sich auch unter Belastung (z.B. während eines Stresstests) oder unmittelbar danach zu entspannen.